Po zakończeniu kariery Alexander Maier zadebiutował w Pucharze Świata w snowboardzie 4 grudnia 1999 roku . Swój pierwszy najwyższy wynik osiągnął w styczniu 2000 roku, zajmując dziewiąte miejsce w slalomie gigancie w Schönried . W swoim pierwszym pełnym sezonie Pucharu Świata odniósł największe sukcesy w swojej karierze. Po podium w snowboardzie cross zdobył brązowy medal w tej dyscyplinie na Mistrzostwach Świata w Madonna di Campiglio w styczniu 2001 roku . W marcu świętował swoje pierwsze dwa zwycięstwa w Pucharze Świata i triumfował w próbie kostiumowej olimpijskiej w Park City oraz w Ruka w wyścigach równoległych. Zakończył sezon na trzecim miejscu w Pucharze Świata SBX i został wybrany Rookie of the Year . Po zakończeniu sezonu został mistrzem kraju w slalomie równoległym.
W następnych latach nie był w stanie kontynuować tych sukcesów. Po tym, jak świętował swoje trzecie zwycięstwo w Pucharze Świata w Arosie w styczniu 2002 roku, zajął dziesiąte miejsce w równoległym slalomie gigancie na igrzyskach olimpijskich . W kolejnych igrzyskach olimpijskich i trzech innych zawodach Pucharu Świata nie wywalczył jedenastego miejsca na Kreischberg 2003 . 1 maja 2008 ogłosił rezygnację z aktywnego ścigania się po niezadowalających wynikach. Oprócz trzech zwycięstw zdobył sześć innych miejsc na podium w Pucharze Świata, z czego dwa w SBX. Jako najlepszy wynik w równoległym mundialu zajął piąte miejsce w sezonie 2001/02.
Alexander Maier to młodszy brat byłego zawodnika narciarskiego Hermanna Maiera i kuzyn byłego zawodnika Andrei Fischbacher . Po zakończeniu swojej aktywnej kariery wyszkolony sprzedawca detaliczny przejął zarządzanie szkołą narciarską Hermann Maier w swoim rodzinnym mieście Flachau . Jest żonaty od 2008 roku.