Pankratow pojawił się po raz pierwszy na Europejskich Zimowych Dniach Młodzieży 1999 w Szczyrbskim Plesie . Tam wywalczył srebrny medal na 10 km stylem klasycznym. Na Mistrzostwach Świata Juniorów w Narciarstwie Klasycznym w 2001 roku w Karpaczu zajął siódme miejsce na dystansie 10 km w klasie klasycznej i został mistrzem świata juniorów w rosyjskiej sztafecie 4x10 km. Rok później na Mistrzostwach Świata Juniorów w 2002 roku w Schonach w Schwarzwaldzie zajął dopiero 42. miejsce na dystansie 30 kilometrów. Swój pierwszy wyścig Pucharu Świata pobiegł w styczniu 2003 roku w Kavgolovo , który ukończył klasycznie na 23. miejscu na dystansie 10 km i tym samym zdobył swoje pierwsze punkty w Pucharze Świata. W tym samym miesiącu zdobył złoto na dystansie 10 km klasykiem i sztafetą na Zimowej Uniwersjada 2003 w Tarvisio . Na początku sezonu 2003/04 zajął swoje pierwsze miejsce w pierwszej dziesiątce Pucharu Świata w Kuusamo z szóstym miejscem na 15 km w stylu klasycznym i po raz pierwszy stanął na podium w Davos z drugim miejscem na 15 km w stylu klasycznym. W dalszej części sezonu osiągnął pięć wyników w pierwszej dziesiątce Pucharu Świata, w tym trzecie miejsce w sztafecie w La Clusaz iw Otepää . W marcu 2004 odniósł swoje pierwsze zwycięstwo w Pucharze Świata w Lahti wraz z Wasilijem Rotschew w sprincie drużynowym. Zakończył sezon na 20. miejscu w klasyfikacji generalnej Pucharu Świata i 18. w dystansie Pucharu Świata. W kolejnym sezonie pięciokrotnie finiszował w Pucharze Świata, w tym trzykrotnie w pierwszej dziesiątce, a na koniec sezonu zajął 35. miejsce w klasyfikacji generalnej Pucharu Świata i 25. w dystansie Pucharu Świata. Podczas najważniejszego sezonu, Mistrzostw Świata w Narciarstwie Klasycznym 2005 w Oberstdorfie , zdobył brązowy medal ze sztafetą. Zajął również 29. miejsce w biegu na 50 km ze startu wspólnego i dziesiąte miejsce w skiathlonie . Jego najlepszym wynikiem w Pucharze Świata w sezonie 2005/06 było dziewiąte miejsce w skiathlonie w Oberstdorfie. Na Zimowych Igrzyskach Olimpijskich 2006 w Turynie zajął 18. miejsce w wyścigu ze startu wspólnego na 50 km. Po zajęciu drugiego miejsca na początku sezonu 2006/07 w sztafecie w Gällivare , odniósł swoje drugie zwycięstwo w Pucharze Świata w La Clusaz dzięki sztafecie. Na Tour de Ski 2006/07 był dziesiąty w klasyfikacji generalnej z trzema miejscami w pierwszej dziesiątce. Na kolejnym Pucharze Świata w Rybińsku zajął drugie miejsce w sprincie. Na Mistrzostwach Świata w Narciarstwie Klasycznym 2007 w Sapporo udało mu się zdobyć srebrny medal w sztafecie razem z Wasilijem Rotschew , Alexandrem Legkowem i Evgenim Dementjewem . Zajął również 36. miejsce w biegu na 15 km stylem dowolnym i dziewiąte miejsce w biegu na 50 km ze startu wspólnego. Aby rozpocząć Puchar Świata, ale był ze Światowej Federacji Narciarskiej FIS z pięciodniową barierą ochronną z powodu nadmiernej ilości hemoglobiny . Na koniec sezonu osiągnął 21 miejsce w Pucharze Świata w sprincie i 16 miejsce w klasyfikacji generalnej Pucharu Świata. Na początku kolejnego sezonu był w Beitostølen z trzecim sezonem. Na Tour de Ski 2007/08 zajął 18. miejsce. W Novym Mieście zajął trzecie miejsce na 15 km klasykiem. Na kolejnym Pucharze Świata w Canmore odniósł jedyne indywidualne zwycięstwo w Pucharze Świata w skiathlonie. Zakończył sezon na 24. miejscu w klasyfikacji generalnej Pucharu Świata i na 14. miejscu w Pucharze Świata na dystansie. W sezonie 2008/09 zajął 31. miejsce w Tour de Ski 2008/09 i 41. miejsce w finale Pucharu Świata w narciarstwie biegowym w Falun . Jego najlepszym wynikiem w sezonie w Pucharze Świata było ósme miejsce na 15 km klasykiem w Novym Mieście . Po zajęciu drugiego miejsca w sztafecie w Beitostølen na początku sezonu 2009/10 odniósł swoje jedyne klasyczne zwycięstwo w Pucharze Europy Wschodniej w Krasnogorsku na dystansie 30 km . Na Zimowych Igrzyskach Olimpijskich 2010 w Vancouver zajął 32. miejsce w skiathlonie i ósmy w sztafecie. Pod koniec sezonu zajął 23. miejsce w finałach Pucharu Świata w narciarstwie biegowym w Falun i zajął 45. miejsce w klasyfikacji generalnej Pucharu Świata . Po tym, jak we wrześniu 2010 roku w pobliżu Pankratowa na granicy austriacko-szwajcarskiej odkryto 22 ampułki preparatu krwi cielęcej Actovegin i innych środków antydopingowych, Rosyjski Związek Narciarski RSA nałożył na niego dwuletni zakaz dopingu w styczniu 2011 roku. Po wygaśnięciu zakazu wystartował w wojskowych mistrzostwach świata w Sodankylä w marcu 2014 roku . Tam zajął 21. miejsce.