Proteobacteria

Proteobacteria
Citrobacter freundii (obraz z wtórnego mikroskopu elektronowego)

Citrobacter freundii (obraz z wtórnego mikroskopu elektronowego )

Systematyka
Klasyfikacja : Kreatura
Domena : Bakterie (bakterie)
Dział : Proteobacteria
Nazwa naukowa
Proteobacteria
Garrity i in. 2005

Proteobacteria stanowią jedną z największych grup domeny z bakterii , traktowane jako podziałów lub szczepów (w sensie gromady ) . Obejmują one wiele istotnych azot bakterii i patogenów.

Nazwa Proteobacteria pochodzi od greckiego boga Proteusa , który mógł zmieniać kształt i nawiązuje do różnorodności kształtów w tej grupie. Dlatego nie jest morfologicznie, ale jest definiowany przez pokrewne sekwencje RNA . Ściany komórkowe Proteobacteria składają się w szczególności z jednowarstwowej do jednowarstwowej mureiny i lipopolisacharydów , dlatego są one gram-ujemne . Jednak niektóre gatunki reagują również na zmienne gramatyczne, takie jak B. Azospirillum brasilense i gatunki Methylobacterium . Wiele gatunków ma wici , inne są w stanie się ślizgać.

Niektóre podgrupy, takie jak Rhodospirillaceae ( purpurowe bakterie ) i Chromatiaceae (purpurowe bakterie siarkowe) są zdolne do beztlenowej fotosyntezy w warunkach beztlenowych . Wykorzystują substancje organiczne, siarkowodór , siarkę lub wodór jako donory elektronów i dlatego nie wytwarzają żadnego pierwiastkowego tlenu .

Podgrupa myksobakterii jest jak dotąd jedyną znaną grupą proteobakterii w obszarze przejściowym między życiem jednokomórkowym a wielokomórkowym. Myksobakterie tworzą wielokomórkowe owocniki z zarodnikami, co jest zbieżnością z śluzowcami .

Proteobakterie zostały początkowo podzielone na pięć głównych grup, które uznano za klasę i nadano im greckie litery Alpha do Epsilon jako przedrostek: Alphaproteobacteria , Betaproteobacteria , Gammaproteobacteria , Deltaproteobacteria i Epsilonproteobacteria . Z biegiem czasu opisano cztery inne klasy (stan na 2020 r.): „ Zetaproteobacteria ”, Acidithiobacillia , Hydrogenophilalia i Oligoflexia .

W mitochondriach z eukariontów , wszystkie żywe istoty z jądra komórkowego, może pochodzić od endosymbiotycznymi Proteobacteria ( patrz: endosymbiotycznymi hipotezy ).

Systematyka

Poniżej wymieniono kilka ważnych rzędów, rodzin i rodzajów ośmiu klas proteobakterii. Artykuł Systematics of Bacteria jest odniesieniem w Wikipedii i zawiera większy wybór taksonów z rodzaju Proteobacteria.

Acidithiobacillia

  • Rodzina Acidithiobacillaceae
  • Rodzina Thermithiobacillaceae

Alphaproteobacteria

i inne taksony

Betaproteobacteria

i inne taksony

Gammaproteobacteria

  • Rozkaz II. "Xanthomonadales"

W ramach LPSN ( Lista nazw prokariotycznych ze stojącą w nomenklaturze ), ważnej listy systematyki bakteryjnej, rząd Xanthomonadales nie jest już wymieniony. To zamówienie i jedyna dostarczona rodzina Xanthomonadaceae zostały rozwiązane w wyniku ostatnich badań. Wiele rodzajów jest teraz przypisanych do rzędu Lysobacterales , inne nie są jeszcze przypisane do żadnego specjalnego rzędu. Jednak stary system jest nadal w użyciu. B. w bazie taksonomicznej NCBI ( National Center for Biotechnology Information ), która jest ważnym źródłem informacji o bakteriach, jest nadal używana.

  • Zamów XII. Enterobacterales , wcześniej określane jako zamówienie „Enterobacteriales”
i inne taksony

Hydrogenophilalia

tylko z jednym rodzajem Hydrogenophilus

Deltaproteobacteria

i inne taksony

Epsilonproteobacteria

i inne taksony

Oligoflexia

  • Zamówienie I. Oligoflexales
  • Rodzina Oligoflexaceae
  • Rozkaz II Silvanigrellales
  • Silvanigrellalaceae

„ Zetaproteobacteria ”

puchnąć

literatura

  • Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (red.): The Prokaryotes, A Handbook of the Biology of Bacteria . 7 tomów, wydanie trzecie, Springer-Verlag, New York et al. O., 2006, ISBN 0-387-30740-0 . Vol. 5: Proteobacteria: Alpha i Beta Subclass ISBN 0-387-30745-1 ; Vol. 6: Proteobacteria: Gamma Subclass ISBN 0-387-30746-X ; Tom 7: Proteobacteria: Delta i Epsilon Subclass , ISBN 0-387-30747-8
  • George M. Garrity , Don J. Brenner , Noel R. Krieg, James T. Staley (red.): Bergey's Manuał of Systematic Bacteriology: Tom 2: Proteobacteria, Część B: The Gammaproteobacteria . Wydanie 2. Springer-Verlag, New York 2005, ISBN 978-0-387-95040-2 , doi : 10.1007 / 0-387-28022-7 .
  • George M. Garrity, Don J. Brenner, Noel R. Krieg, James T. Staley (red.): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: Tom 2: The Proteobacteria, Part C: The Alpha-, Beta-, Delta- i Epsilonproteobacteria . Wydanie 2. Springer-Verlag, New York 2005, ISBN 978-0-387-24145-6 , doi : 10.1007 / 0-387-29298-5 .

Indywidualne dowody

  1. ↑ a b Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Klasyfikacja domen i typów - Hierarchiczna klasyfikacja prokariotów (bakterii). W: Lista nazw prokariotycznych ze stojącymi w nomenklaturze (LPSN). Źródło 20 grudnia 2019 r .
  2. ↑ KP Williams, DP Kelly: Propozycja nowej klasy w obrębie gromady Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., Z typem rzędu Acidithiobacillales i poprawiony opis klasy Gammaproteobacteria . W: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . Nie. 63 , sierpień 2013, s. 2901-2906 , doi : 10.1099 / ijs.0.049270-0 .
  3. ^ BJ Tindall: nazwisko Solimonadaceae Losey et al. Rok 2013 jest bezprawny, propozycje stworzenia nazwy grzebień „Sinobacter soli”. lis. i „Sinobacter variicoloris” są sprzeczne z Kodeksem, nazwisko rodzinne Xanthomonadaceae Saddler i Bradbury 2005 oraz nazwa rzędu Xanthomonadales Saddler i Bradbury 2005 są niezgodne z prawem i uwagi dotyczące stosowania nazw rodzinnych Solibacteraceae Zhou et al. 2008, Nevskiaceae Henrici and Johnson 1935 (Approved Lists 1980) oraz Lysobacteraceae Christensen and Cook 1978 (Approved Lists 1980) oraz nazwa rzędu Lysobacteriales Christensen and Cook 1978 (Approved Lists 1980) w odniesieniu do klasyfikacji odpowiednich rodzajów Solibacter Zhou et al. . 2008, Nevskia Famintzin 1892 (Approved Lists 1980) oraz Lysobacter Christensen and Cook 1978 (Approved Lists 1980) oraz znaczenie dokładnego wyrażenia związku między nazwą taksonomiczną, jej autorami a odpowiednim opisem / opisem / poprawką w : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB) tom 64, s. 293–297. DOI: 10.1099 / ijs.0.057158-0
  4. ↑ M. Adeolu, S. Alnajar, S. Naushad, RS Gupta: Filogeneza oparta na genomie i taksonomia „Enterobacteriales”: propozycja dla Enterobacterales ord. lis. podzielone na rodziny Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov. i Budviciaceae fam. lis. W: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Nie. 66 , grudzień 2016, s. 5575-5599 , doi : 10.1099 / ijsem.0.001485 .
  5. ↑ R. Nakai, M. Nishijima, N. Tazato, Y. Handa, F. Karray, S. Sayadi, H. Isoda, T. Naganuma: Oligoflexus tunisiensis gen. Nov., Sp. nov., Gram-ujemna, tlenowa, nitkowata bakteria nowej linii proteobakterii, oraz opis Oligoflexaceae fam. nov., Oligoflexales ord. lis. i Oligoflexia classis nov. W: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . Nie. 64 , październik 2014, s. 3353-3359 , doi : 10.1099 / ijs.0.060798-0 .
  6. ↑ Martin W. Hahn, Johanna Schmidt, Ulrike Koll, Manfred Rohde, Susanne Verbarg, Alexandra Pitt, Ryosuke Nakai, Takeshi Naganuma, Elke Lang: Silvanigrella aquatica gen. Nov., Sp. lis., wyizolowany ze słodkowodnego jeziora, opis Silvanigrellaceae fam. lis. i Silvanigrellales ord. nov., reklasyfikacja rzędu Bdellovibrionales w klasie Oligoflexia, ponowna klasyfikacja rodzin Bacteriovoracaceae i Halobacteriovoraceae do nowego rzędu Bacteriovoracales ord. nov. i ponowna klasyfikacja rodziny Pseudobacteriovoracaceae do rzędu Oligoflexales . W: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . Nie. 67 , sierpień 2017, s. 2555-2568 , doi : 10.1099 / ijsem.0.001965 .
  7. ↑ David Emerson, Jeremy A. Rentz, Timothy G. Lilburn, Richard E. Davis, Henry Aldrich, Clara Chan, Craig L. Moyer, Anna-Louise Reysenbach: A Novel Lineage of Proteobacteria zaangażowana w tworzenie morskiej maty drobnoustrojowej utleniającej żelazo Społeczności . W: PLoS ONE . taśma 2 , nie. 8 , sierpień 2007, s. e667 , doi : 10.1371 / journal.pone.0000667 .

linki internetowe

Commons : Proteobacteria  - zbiór zdjęć, filmów i plików audio
 Wikispecies: Proteobacteria  - Species Directory